Le CIDR mène une grande partie de ses programmes en copromotion avec des Organisations du Sud.

À titre d’exemples :

 Alliance Santé (Bénin).
 Solidarité et Développement - SOLIDEV (Bénin).
 Microfinance et Developpement - MIFED (Cameroun).
 Institutions de Microfinance : BUSAA GONOFA, ESHET, Wasasa (Ethiopie).
 Oromo Grass-Roots Development Organisation - HUNDEE (Ethiopie).
 Saving And Credit Cooperatives (Kenya).
 Association pour la Promotion de l’Entreprise à Madagascar - APEM (Madagascar).
 Initiatives-Conseils-Développement - ICD (Mali).
 Save for Health - UGANDA (Ouganda).
 PRIDE (Tanzanie).

Les partenaires institutionnels dans les pays d’intervention sont de trois types :

 des organes gouvernementaux (Ministères de l’Economie et des Finances, de la Santé, de l’Intérieur et/ou de l’Administration Territoriale, de l’Agriculture, de l’Aménagement du Territoire,etc.) ; des services publics (formations sanitaires publiques, Maison des collectivités locales, Agence nationale pour l’emploi) et des collectivités locales (provinces, régions, communes).

 des établissements bancaires dans le secteur de la microfinance (Bank of Africa - BOA au Burkina ; Banque Internationale du Cameroun pour l’Epargne et le Crédit - BICEC ; Banque Nationale de Développement Agricole - BNDA au Mali).

 des organisations confessionnelles, notamment dans le secteur de la santé, où elles sont souvent très engagées (Uganda Protestant Medical Bureau, Moravian Church of Tanzania,etc.)